其实，我们在安装电脑或者服务器的系统时，会让你选择NTFS和FAT或FAT32文件系统，但是三者之间有什么区别呢？听我们慢慢来说FAT和FAT32或NTFS文件系统的区别。

        运行Windows Server 2003操作系统的计算机的磁盘分区可以便用3种类型的文件系统：NTFS、FAT和FAT32。安装Windows Server 2003操作系统的用户建议使用NTFS文件系统。FAT和FAT32文件系统很相似，只是FAT32文件系统更适合于较大容量的硬盘(对于大硬盘来说，最佳的文件系统是NTFS文件系统)。

        NTFS文件系统是使用Windows Server 2003操作系统所推荐的文件系统，它提供了服务器或工作站所需的安全保障。NTFS具有FAT文件系统的所有基本功能，与FAT文件系统相比最大的特点是安全性，并且提供了FAT或FAT32文件系统所没有的优点。在NTFS分区上，支持随机访问控制和拥有权，对共享文件夹无论采用FAT文件系统还是NTFS都可以指定权限，以免受到本地访问或远程访问的影响；对于在计算机上存储文件夹或单个文件，或者是通过连接到共享文件夹访问的用户，都可以指定权限，使每个用户只能按照系统赋予的权限进行操作，充分保护了系统和数据的安全。NTFS使用事务日志自动记录所有文件夹和文件更新，当出现系统损坏和电源故障等问题而引起操作失败后，系统能利用日志文件重做或恢复未成功的操作。它还支持磁盘压缩性能；支持最大达2TB的大硬盘(NTFS可支持的最大磁盘容量比FAT文件系统大得多，而且随着磁盘容量的增大，NTFS的性能不像FAT文件系统那样随之降低)；支持双重启动配置(在同一台计算机上同时安装有Windows Server 2003和其他操作系统)。

         只有一种情况可能需要使用FAT或FAT32文件系统，就是确有必要配置Windows Server 2003和早期操作系统的双重启动。在这种情况下，就应该把系统配置成双重启动并在硬盘上用FAT或FAT32文件系统分区作为主分区(启动分区)。这是因为早期的操作系统不能访问采用最新版本NTFS格式的本地硬盘分区，唯一的例外就是Windows NT 4.0加上Service Pack 4或更高版本，它能够访问这种硬盘分区，但也有所限制。Windows NT不能访问使用NTFS新特性存储的本地文件，因为这些NTFS新特性在Windows NT 4.0．发布时还没有出现。如果服务器不需要配置双重启动功能，建议文件系统采用NTFS格式。